7月9日，中足联官网发布《关于对北京理工足球俱乐部队违规违纪的处罚决定》，中乙北京理工足球俱乐部因“违反规定试图向裁判员赠送礼品，扰乱比赛秩序，破坏足球行业风气”被中足联处以通报批评，并处罚款人民币10万元。
此外，中足联也对北京赛区（北京理工足球俱乐部主场）开出罚单，因“中乙联赛北京赛区（北京理工足球俱乐部主场）将应由赛区负责的比赛官员接待工作违规转交给北京理工足球俱乐部”，对其予以通报批评。
本赛季，中乙还曾有球队因在客队休息室放置封建迷信物品被罚。北京时间7月2日晚间，中足联官方发布公告，对长春喜都俱乐部在客队休息室放置封建迷信物品的行为进行处罚，通报批评并罚款3万元。